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Material for the course "Grundlagen der Systemadministration" in the winter semester 25/26

Data

Demo data consists of random subsamples of the miRBase hairpin.fa.

Tasks

1. Erstelle in jedem Verzeichnis den Unterordner index und verschiebe jeweils alle .fai Dateien dort hinein.
2. Verschiebe alle .fa Dateien in den Hauptordner und benenne sie dabei um von ab/xy.fa zu ab_xy.fa
3. Welche fasta Datei ist die kleinste/größte?
4. Welche fasta Datei enthält die wenigsten/meisten Sequenzen?
5. Welche Sequenz ist am längsten? Wie lang ist sie?
6. In welchen Dateien kommt diese Sequenz vor?
7. Welche Sequenz(en) ist/sind genau 299 bp lang?
8. In wie vielen Dateien kommen sie jeweils vor?
9. Welche Sequenz kommt am häufigsten vor?
10. Wie viele Sequenzen kommen nur ein einziges mal vor?

Solutions

3. kleinste: 00_02, größte: 00_09
4. wenigste: 00_02, meiste: 00_09
5. atr-MIR8563, 451

Participants

• Markus - iimog
• Konstantin - Konnor-acc
• Vincent Holleber - VincHoll
• Jay - BlueJae20
• Cedric - Odjn
• Volker - VK339
• Luc - Luck44s
• Yann - [G-allow]
• Merlin - msebeikat