fMRI Experimental Protocol and Paradigm : Seokjin Moon, Taeyang Lee (Based on Horikawa et al., 2020 β The Neural Representation of Visually Evoked Emotion Is High-Dimensional, Categorical, and Distributed Across Transmodal Brain Regions)
Department of Brain & Cognitive Sciences Connectome Lab (Prof. Jiook Cha) Written by SeokJin Moon, Taeyang Lee
-
μ°κ΅¬ κ°μ (Introduction) λ³Έ μ°κ΅¬λ Horikawa et al. (2020)μμ μ μλ Visually Evoked Emotion fMRI paradigmμ μμ μ¬ν(replicate)νλ κ²μ κΈ°λ³ΈμΌλ‘ νλ, μΆκ°μ μΌλ‘ μμ¬μ κ°μ λ³νλ₯Ό ν¬ν¨ν λ¨νΈ μ λλ©μ΄μ (short film)κ³Ό μμ μκ·Ή(music)μ κ²°ν©νμ¬ νμ₯ν ννλ‘ μ€κ³λμλ€. μ¦, λ³Έ μ°κ΅¬λ μΈ κ°μ§ μκ·Ή μ νμ ν¬ν¨νλ€: (1) μκ°μ 무μ μμ (Horikawa et al., 2020), (2) κ°μ μμ¬λ₯Ό μ§λ λ¨νΈ μ λλ©μ΄μ One Small Step (Vaccaro et al., 2024), (3) μμ κΈ°λ° κ°μ μκ·Ή (McClay et al., 2023).
-
μ°κ΅¬ λ°©λ² (Methods) 2.1 Participants and Session Structure λ³Έ μ€νμ 1β2λͺ μ νΌνμλ₯Ό λμμΌλ‘ μνλλ©°, λͺ¨λ μ°Έκ°μλ μ μ λλ κ΅μ μλ ₯ λ° μ²λ ₯μ κ°μ§ μ±μΈμΌλ‘ λͺ¨μ§λλ€. κ° νΌνμλ μ΄ 9νμ fMRI session(session)μ μ°Έμ¬νλ©°, κ° sessionμ κΈΈμ΄λ μ½ 60β90λΆμ΄λ€. session κ° μ΅μ 24μκ°μ κ°κ²©μ μ μ§νμ¬ νΌλ‘ λμ κ³Ό μ μμ habituationμ λ°©μ§νλ€. session μ νλ‘ μ¬μ /μ¬ν μ€λ¬Έ(pre/post-experiment survey)μ μννμ¬ μ°Έκ°μμ μΈκ΅¬ν΅κ³ μ 보, μ μ μν(μ°μΈ, λΆμ μ²λ ν¬ν¨), μ€ν μ€ νΌλ‘λ λ° λͺ°μ λ λ±μ μΈ‘μ νλ€. λͺ¨λ μ€λ¬Έμ Google form μΌλ‘ μ§νλλ©° μλ΅μ μ΅λͺ νλλ€.
2.2 Stimulus Presentation (a) Horikawa Visual Stimuli Horikawa et al. (2020)μ μ°κ΅¬μ μ¬μ©λ 2,181κ°μ μ§§μ 무μ λΉλμ€ ν΄λ¦½ μ 체λ₯Ό μκ·ΉμΌλ‘ μ¬μ©νλ€. κ° μμμ νκ· 5β10μ΄ κΈΈμ΄μ 무μ μκ° μκ·ΉμΌλ‘, μΈκ°, λλ¬Ό, μμ°, μ¬νμ μνΈμμ© λ± λ€μν κ°μ μ μν©μ ν¬ν¨νλ€. κ° μμμ νλ©΄ μ€μμ 12Β° μμΌκ°(visual angle)μΌλ‘ μ μλλ©°, λ°°κ²½μ μ€κ° νμ(mid-gray / 128,128,128)μΌλ‘ μ€μ λλ€. μ μ°κ΅¬μ μ¬νμ±μ κ·ΉλννκΈ° μν΄, μκ·Ή μ μ μμ λ° sessionκ³Ό run(run) ꡬμ±μ μλ³Έ μ°κ΅¬λ₯Ό κ·Έλλ‘ λ°λ₯Έλ€.
(b) Narrative Short Film (One Small Step) Vaccaro et al. (2024)μμ μ¬μ©λ λ¨νΈ μ λλ©μ΄μ One Small Step (2018) μ μ¬μ©νλ€. μ΄ μμμ λλ ·ν μμ¬ κ΅¬μ‘°λ₯Ό ν΅ν΄ κΈμ , λΆμ , κ·Έλ¦¬κ³ λ³΅ν©μ μΈ κ°μ μνμ μ μ΄λ₯Ό μμ°μ€λ½κ² μ λνλ€. λ³Έ μ°κ΅¬μμλ μ΄ μμμ λ³λμ fMRI runμΌλ‘ μ½μ νμ¬, μμ¬μ λ§₯λ½μ μ§λ μ₯κΈ°μ κ°μ μ μ΄κ° λμ νλ ν¨ν΄μμ μ΄λ»κ² λ°μλλμ§λ₯Ό νμνλ€. μμμ 무μ μνλ‘ μ μλλ©°, Horikawa μκ·Ήκ³Ό λμΌν μκ°μ μΈν μ μ μ§νλλ‘ νλ€.
(c) Musical Stimuli McClay et al. (2023)μ μ°κ΅¬λ₯Ό κΈ°λ°μΌλ‘ μ€κ³λ μμ μκ·Ή μΈνΈ(10κ°)λ₯Ό μ¬μ©νλ€. μκ·Ήμ μ λ¬Έ μ곑κ°λ€μ΄ μ곑ν μ€λ¦¬μ§λ μ€μΌμ€νΈλΌ μμμΌλ‘, κΈ°μ¨(joyous), λΆμ(anxious), μ¬ν(sad), νμ¨(calm)μ λ€ κ°μ§ κ°μ ν λ§λ₯Ό μ λ°νλλ‘ μ€κ³λμλ€. κ° μμμ μ½ 120μ΄ κΈΈμ΄λ‘, 3κ°μ λλ ·ν κ°μ ꡬκ°(30-40μ΄)κ³Ό κ·Έ μ¬μ΄λ₯Ό μλ μ ν ꡬκ°(6-9μ΄)μ ν¬ν¨νλ€. μμ μ μ€μΊλ λ΄ ν€λν°μ ν΅ν΄ μ μλλ©°, νΌνμλ νλ©΄ μ€μμ μ μλλ νμ λ°°κ²½μ fixation crossλ₯Ό μμνλλ‘ νλ€.
2.3 Experimental Procedure & Run Structure (Block design) μ€ν μμ μ , νΌνμμκ² λ³Έ μ°κ΅¬μ λͺ©νλ μκ·Ήμ΄ μ§λ κ°κ΄μ μΈ κ°μ μμ±(μ: 'μ΄ μμμ μ¬ν μμμ΄λ€')μ νκ°νλ κ²μ΄ μλλΌ, κ° μκ·Ήμ κ²½ννλ λμ μ£Όκ΄μ μΌλ‘ λκ»΄μ§λ μμ μ κ°μ (μ: 'μ΄ μμμ 보λ μ¬νλ€')μ μ§μ€νλ κ²μμ λͺ νν μλ΄νλλ‘ νλ€. λ³Έ μ€νμ μ΄ 9νμ Main SessionμΌλ‘ ꡬμ±λλ€. μ΄ μ€ 8κ° sessionμ Horikawa et al. (2020)μ μκ° μκ·Ή ν¨λ¬λ€μ μ¬νμ ν λΉλλ©°, λ§μ§λ§ 1κ° sessionμ μμ¬ μμ(One Small Step) λ° μμ μκ·Ή κ³Όμ λ₯Ό μν΄ λ³λλ‘ μ§νλλ€. λͺ¨λ sessionμ λ³Έ κ³Όμ μμ μ , νΌνμμ κ³Όμ μ μ°¨ λ° fMRI νκ²½ μ μμ λκΈ° μν Practice BlockμΌλ‘ μμνλ€. λͺ¨λ μκ·Ή μ μλ PsychoPy μννΈμ¨μ΄λ₯Ό μ¬μ©νμ¬ μ μ΄λλ€.
2.3.1 Main Sessions 1β8: Horikawa Visual Stimuli Paradigm μ΄ 61κ°μ Horikawa μμ μκ·Ή runμ 8κ°μ sessionμ κ±Έμ³ λΆλ°°νμ¬ μ§ννλ€ (Session per 7-8 runs). κ° sessionμ μ μ°¨λ λ€μκ³Ό κ°λ€. β’ Practice Runs: κ° sessionμ λ³Έ κ³Όμ μμ μ , νΌνμλ 3-5κ°μ μ§§μ(μ½ 5-10μ΄) μ€λ¦½μ μΈ μ νλΈ μμ ν΄λ¦½μ μμ²νλ μ°μ΅ μνμ μννλ€. μ΄λ₯Ό ν΅ν΄ νΌνμλ μ€μΊλ λ΄ μμ μμ² νκ²½μ μ μνλ μκ°μ κ°λλ€. μκ·Ή μ μμ κ΄ν λͺ¨λ μ¬νμ Horikawa μ λμΌνκ² μ μ©νλ€. β’ Horikawa Runs: o Run Structure: κ° runμ λ€μμ μμ°¨μ ꡬ쑰λ₯Ό λ°λ₯Έλ€: 32μ΄ Baseline Rest β 36ν Stimulus Blocks β 6μ΄ End Rest o Stimulus Block : νλμ blockμ μμ μ μ ꡬκ°κ³Ό κ·Έ λ€μ μ€λ 2μ΄μ Inter-Block Restλ‘ κ΅¬μ±λλ€. ο§ μμ κΈΈμ΄ < 8μ΄: μ΄ μ μ μκ°μ΄ 8μ΄λ₯Ό μ΄κ³Όν λκΉμ§ μμμ΄ λ°λ³΅ μ¬μλλ€. ο§ μμ κΈΈμ΄ β₯ 8μ΄: μμμ΄ 1ν μ¬μλλ€. μ΄λ, blockμ μ΄ κΈΈμ΄κ° TR(2μ΄)μ λ°°μκ° λλλ‘ μμ λ€μ μ§§μ restκ° μΆκ°λ μ μλ€. β’ νΌνμ κ³Όμ : νΌνμλ μμμ΄ μ μλλ λμμλ μμ λ‘κ² μμ²νλ©°(free-viewing), λͺ¨λ rest κΈ°κ°(baseline, inter-block, end rest)μλ νλ©΄ μ€μμ κ³ μ μμ(fixation cross)λ₯Ό μμνλ€.
β 2.3.2 Main Session 9: Narrative and Musical Stimuli Paradigm λ§μ§λ§ μΈμ μ μμ¬ μμ κ³Όμ μ μμ μκ·Ή κ³Όμ λ₯Ό μμ°¨μ μΌλ‘ μ§ννλ©°, κ° κ³Όμ μμ μ λ³λμ Practice Blockμ ν¬ν¨νλ€. (a) Narrative Video Stimulus Run β’ Practice Block: 본격μ μΈ κ³Όμ μ μμ, νΌνμλ 3-5κ°μ μ€λ¦½μ μΈ μ νλΈ μμ ν΄λ¦½μ μμ²νλ μ°μ΅ blockμ μννλ€. β’ Run Structure: Vaccaro et al. (2024)μ μ°κ΅¬ μ μ°¨μ λ°λΌ, μ½ 454μ΄(7λΆ 34μ΄) κΈΈμ΄μ μ λλ©μ΄μ One Small Step μ 체λ₯Ό νλμ λ 립λ runμΌλ‘ μ μνλ€. μμμ μ€κ° rest μμ΄ ν λ²μ μ°μμ μΌλ‘ μμλλ€. 32μ΄ Baseline Rest β 454μ΄ Stimuli Block β 6μ΄ End Rest β’ νΌνμ κ³Όμ : νΌνμλ μμμ΄ μ μλλ λμμλ μμ λ‘κ² μμ²νλ©°(free-viewing), λͺ¨λ rest κΈ°κ°(baseline rest, end rest)μλ νλ©΄ μ€μμ κ³ μ μμ(fixation cross)λ₯Ό μμνλ€.
(b) Musical Stimuli Runs β’ Practice Block: μμ μκ·Ή κ³Όμ μμ μ , νΌνμλ McClay et al. (2023) μ°κ΅¬μμ μ¬μ©λ λ³λμ μ°μ΅μ© μμ('dreamy' ν λ§)μ μ΄μ©ν 1νμ Practice Blockμ μννμ¬ κ³Όμ λ°©μμ μ΅μν΄μ§λ€. β’ Run Structure: μ΄ 10κ°μ μμ μκ·Ήμ΄ κ°κ° νλμ λ 립λ run(μ΄ 10 runs)μΌλ‘ μ μλλ€. o κ° runμ μ½ 120μ΄ κΈΈμ΄μ μμ ν 곑μΌλ‘ ꡬμ±λλ€. β’ νΌνμ κ³Όμ : νΌνμλ fMRI νΈν ν€λν°μ ν΅ν΄ μμ μ κ°μνλ©°, νλ©΄ μ€μμ μ μλλ κ³ μ μμ(fixation cross)λ₯Ό μμνλλ‘ μ§μ λ°λλ€. μ΄ run λμμλ λ³λμ μ΄λ―Έμ§ μ μκ° μλ€. β 2.4 Post-scan Behavioral Rating λͺ¨λ fMRI μΈμ μλ£ ν, νΌνμλ λ³λμ νλ μ€νμ€μμ μκ·Ήμ λν μ°μμ μΈ κ°μ νκ°(continuous emotion rating)λ₯Ό μννλ€. β’ Rating Procedure: μΈμ μ΄ λλλ©΄, νΌνμλ fMRI μ€νμμ μ μλμλ λͺ¨λ μκ° μκ·Ή(Horikawa μμ, One Small Step)κ³Ό μ²κ° μκ·Ή(μμ )μ λ€μ κ²½ννλ€. μκ·Ήμ΄ μ μλλ λμ, νΌνμλ μ‘°μ΄μ€ν±(joystick) λλ λ€μ΄μΌ(dial) μ₯μΉλ₯Ό μ¬μ©νμ¬ μ€μκ°μΌλ‘ λκ»΄μ§λ κ°μ μ λ κ°μ§ ν΅μ¬ μ°¨μ(core affective dimensions)μ νκ°νλ€. o Valence: κ°μ μ κΈμ -λΆμ μ°¨μ (λ§€μ° λΆμΎν¨ ~ λ§€μ° μ μΎν¨). o Arousal: κ°μ μ κ°μ±-μ§μ μ°¨μ (λ§€μ° μ°¨λΆν¨ ~ λ§€μ° ν₯λΆλ¨). β’ Data Collection: νκ° λ°μ΄ν°λ 100ms κ°κ²©(10Hz)μΌλ‘ μνλ§λμ΄, μκ·Ή μ μ μμ κ³Ό λκΈ°ν(synchronize)λ μ°μμ μΈ μκ³μ΄(time-series) λ°μ΄ν°λ‘ μ μ₯λλ€. μ΄ λ°μ΄ν°λ μΆν fMRI λ°μ΄ν°μ TRμ λ§μΆ° λ€μ΄μνλ§(down-sampling)λμ΄ λΆμμ μ¬μ©λλ€. μ΄ κ³Όμ μ ν΅ν΄, μ μ°κ΅¬μμ μ¬μ©λ μ§λ¨ νκ· (group-averaged) νμ κ³Ό λλΆμ΄, νΌνμ κ°μΈμ μλμ μΈ(dynamic) κ°μ λ³ν κΆ€μ μ ν보νλ€.
2.5 fMRI Data Acquisition 2.6 fMRI Data Preprocessing νλλ λͺ¨λ fMRI λ°μ΄ν°λ Horikawa et al. (2020)μ μ°κ΅¬ μ μ°¨λ₯Ό μ격νκ² μ€μνμ¬ μ μ²λ¦¬νλ€. μ μ²λ¦¬ κ³Όμ μ fMRIPrep νμ΄νλΌμΈμ κΈ°λ³ΈμΌλ‘ μ¬μ©νλ©°, μ΄ν μΆκ°μ μΈ λΆμμ μν λ§μΆ€ν λ¨κ³λ₯Ό ν¬ν¨νλ€. β’ 1λ¨κ³: fMRIPrepμ μ΄μ©ν κΈ°λ³Έ μ μ²λ¦¬ fMRIPrep νμ΄νλΌμΈμ μ¬μ©νμ¬ λ€μκ³Ό κ°μ νμ€ μ μ²λ¦¬ κ³Όμ μ μννλ€. o BOLD κΈ°μ€ μμ μμ± (BOLD Reference Image Generation) o λ―Όκ°λ μ곑 보μ (Susceptibility Distortion Correction) o λλΆ μμ§μ 보μ (Head Motion Correction) o μ¬λΌμ΄μ€ μκ° λ³΄μ (Slice Timing Correction) o 곡λ λ±λ‘ (Co-registration) o κ³΅κ° μ¬κ΅¬μ± (Resampling) β’ 2λ¨κ³: λΆμμ μν λ°μ΄ν° μν μμ± fMRIPrepμΌλ‘ μ μ²λ¦¬λ BOLD μ νΈμ λν΄ Horikawa et al. (2020)μ νμ μ²λ¦¬ μ μ°¨λ₯Ό μ μ©νμ¬ μ΅μ’ λΆμμ© λ°μ΄ν° μνμ μμ±νλ€. o λ Έμ΄μ¦ νκ· μ κ±° (Nuisance Regression): κ° runμ 볡μ μκ³μ΄ λ°μ΄ν°μμ λ² μ΄μ€λΌμΈ(constant baseline), μ ν μΆμΈ(linear trend), κ·Έλ¦¬κ³ μμ§μ 보μ κ³Όμ μμ μ°μΆλ 6κ°μ μμ§μ νλΌλ―Έν°(3κ° νμ , 3κ° μ΄λ)λ₯Ό νκ· λ³μλ‘ μ€μ νμ¬ μ κ±°νλ€. o νλ₯μν μ§μ° 보μ (Hemodynamic Delay Correction): νλ₯μνμ λ°μ μ§μ°μ κ³ λ €νμ¬ λͺ¨λ μκ³μ΄ λ°μ΄ν°λ₯Ό 4μ΄(2 TRs)λ§νΌ μκ°μ μΌλ‘ μ΄λμν¨λ€. o μ΄μμΉ μ κ±° (Despiking): κ° run λ΄μμ Β±3 νμ€νΈμ°¨λ₯Ό λ²μ΄λλ κ·Ήλ¨μ μΈ κ°λ€μ μ€μΈλ€. o λΈλ‘ νκ· ν (Block Averaging): κ° μκ·Ή λΈλ‘(μμ μ μ κΈ°κ° + μ΄ν 2μ΄ ν΄μ§κΈ°) λ΄μ μ νΈλ₯Ό νκ· νμ¬ κ°λ³ μκ·Ήμ λν λ¨μΌ λ°μ κ°μ μ°μΆνλ€. o νμ€ν (Standardization): μ΅μ’ μ μΌλ‘, λͺ¨λ μκ·Ήμ λν λ°μ΄ν°λ₯Ό κ° λ³΅μ λ¨μλ‘ z-μ μν(z-score)νμ¬ λ³΅μ κ°μ κΈ°λ³Έ νμ±ν μμ€ μ°¨μ΄λ₯Ό μ κ·ννλ€.