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Adicionar endpoints na API REST#381

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gusmaomatheus wants to merge 72 commits intolmb-embrapa:masterfrom
ax-comp-scl:master
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Adicionar endpoints na API REST#381
gusmaomatheus wants to merge 72 commits intolmb-embrapa:masterfrom
ax-comp-scl:master

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@gusmaomatheus
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@gusmaomatheus gusmaomatheus commented Jun 24, 2025 •
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Funcionalidades adicionadas:

  • Login/Cadastro de usuários;
  • Endpoint de histórico de cargas;
  • Endpoint para carga de ontologies;
  • Endpoint para carga de organism;
  • Endpoint para carga fasta;
  • Endpoint para carga de publication;
  • Endpoint para carga de GFF.
  • Endpoint para o comando remove_organism (organism e fasta);
  • Endpoint para o comando remove_ontology (gene, sequence e relations);
  • Endpoint para o comando remove_file (gff)

gusmaomatheus and others added 30 commits April 10, 2025 22:26
@gusmaomatheus
build: criar configurações docker para facilitar a subida do sistema
78fcb0b
@gusmaomatheus
build: configurações do DJANGOOOOOO
2eb9649
@gusmaomatheus
docs: arquivo para auxiliar subida do sistema
fee4445
@gusmaomatheus
feat: login
d1c192a
@gusmaomatheus
chore: atualizar gitignore
c9ed85c
@abelBaes
fix: adicao de path account para realizacao de login em WEBPROJECT
2a2eb8e
@abelBaes
gardening: remocao de virgula
a71304e
@gusmaomatheus
docs: corrigir URL de clone em ambiente_local.md
d6ee97d
@gusmaomatheus
chore: atualizar gitignore
5053f47
@gusmaomatheus
feat: criar arquivo .env de exemplo
ac765a5
@gusmaomatheus
build: corrigir Dockerfile
f4292ad
@gusmaomatheus
chore: corrigir path do .env.example
ea5ffc2
@gusmaomatheus
feat: criar endpoint de histórico de inserções de carga
5c1da1d 
Endpoint a partir da estrutura que já existia (tabela e model).
@matheusspacifico
refactor(HistoryListSerializer): alteração no serializer para que os …
53850d2 
…dados cheguem propriamente no front
@rickxz
chore: obter configurações de conexão do db pelo env
28122ad
@rickxz
feat(history): adicionar paginação
9c9c483
@rickxz
feat(history): fazer ordenação por data
6ca2776
@abelBaes
feat: adicionado end-point de sequence
58768cc
@abelBaes
Merge branch 'dev' of https://github.com/ax-comp-scl/machado into dev
e0e531f
@PeHenr1
feat: adicionado end-point de publication
0966cca
@gusmaomatheus
feat(loads): imeplements gene ontology load
0bc2469
@gusmaomatheus
Merge branch 'dev' into feature/75
7c0b4a2
@gusmaomatheus
Merge pull request #81 from ax-comp-scl/feature/75
892fa2b 
#75 - Implementação do endpoint Gene ontology
@rickxz
feat(history): adicionar filtragem por palavra chave e ordenação por …
c66f632 
…data
@gusmaomatheus
Merge 'DEV' into 'feature/76'
86555ed
@gusmaomatheus
Merge branch 'dev' into feature/76
4df09b5
@gusmaomatheus
Merge pull request #82 from ax-comp-scl/feature/76
b38042e 
#76 - Implemetação do endpoint Publication (Load)
@gusmaomatheus
Merge pull request #83 from ax-comp-scl/feature/19
86be427 
feature/19
@gusmaomatheus
gardening: identação
52b0866
@gusmaomatheus
gardening: identação
7e7004e
gusmaomatheus and others added 30 commits June 5, 2025 22:08
@gusmaomatheus
fix: corrigir inserção do FASTA
fe7a120
@matos-vinicius
Merge pull request #92 from ax-comp-scl/feature/79
28b2932 
Feature/79
@gusmaomatheus
feat: criar nova rota para carga de GFF
4059a6b
@gusmaomatheus
gardening: identação
933815c
@gusmaomatheus
feat: criar serializer para GFF
5034b89
@gusmaomatheus
feat(views/load): criar ViewSet para GFF
3b8ab9f
@gusmaomatheus
fix(api/urls): corrigir chamada do ViewSet na rota
073843b
@gusmaomatheus
Merge pull request #93 from ax-comp-scl/feature/78_2
eb3c159 
#78 - Implementação Backend - Endpoint GFF
@rickxz
fix(history): arrumar serializer de history.params
1165205
@matos-vinicius
feat(views/load): criar endpoint para remoção de uma carga de 'GFF'
4592ef6
@gusmaomatheus @rickxz
feat(views/load): criar endpoint para remoção de uma carga de 'Organism'
a7ac481
@gusmaomatheus
fix(load/views): corrigir inserção de GFF
33c3fe9
@gusmaomatheus
Merge pull request #103 from ax-comp-scl/feature/95
bc89d76 
Feature/101
@gusmaomatheus
hotfix(account): barrar criação de dois usuários com um mesmo usernam…
0b61281 
…e e/ou email
@rickxz
feat(delete-organism): receber pk corretamente no endpoint de destroy
17c0368
@abelBaes
feat: comando de remove_ontology implementado
1f71944
@abelBaes
feat: atualizando o schema do swagger para deletes
32407e4
@gusmaomatheus
Merge branch 'dev' into feature/100
ecd4869
@gusmaomatheus
Merge pull request #104 from ax-comp-scl/feature/100
7d9eea0 
feat: comando de remove_ontology implementado
@rickxz
gardening: remover arquivos de setup local
c745654
@rickxz
refactor: aplicar linting
42c7c9c
@gusmaomatheus
Merge branch 'master' into dev
bac2d96
@gusmaomatheus
revert(machado/setup): reveter alterações para setup local
b9dfa74
@gusmaomatheus
lint: corrigir pipeline quebrando por conta de configurações de lint …
c89cd7a 
…do 'black'
@gusmaomatheus
revert: deixar setup.py igual master do repositório oficial
669822a
@gusmaomatheus
feat(machado/models): remover model 'Publication'
56aa43c
@gusmaomatheus
revert: reverter alterações nos arquivos .gitignore
7752963
@gusmaomatheus
feat: alterações necessárias para aprovação de PR no repositório oficial
744032b
@gusmaomatheus
Merge pull request #107 from ax-comp-scl/dev
806cf56 
Merge branch 'dev' into master
@gusmaomatheus
fix(urls): mapear endpoint de login
a10f4db
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