Realizado y datos descargados 20/02/2019

Serie de programas que ayudan a comprobar, cuantos de los dominios Pfam mas relevantes encontrados en sus proteinas conocidas en UniProt SW coinciden con los dominios anotados.

Los organismos a buscar son el mono ardilla boliviano y el chimpace

Para facilitar la busqueda de estos organimos tenemos la siguiente informacion:

· Chimpanzee (Pan)

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=9596&lvl=3&p=has_linkout&p=blast_url&p=genome_blast&lin=f&keep=1&srchmode=1&unlock

• Taxonomy ID: 9596 (for references in articles please use NCBI:txid9596) Pan
• Taxonomy ID: 9597 (for references in articles please use NCBI:txid9597) Pan paniscus
• Taxonomy ID: 9598 (for references in articles please use NCBI:txid9598) Pan troglodytes

· Black-capped squirrel monkey(Saimiri boliviensis)

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=39432&lvl=3&p=mapview&p=has_linkout&p=blast_url&p=genome_blast&lin=f&keep=1&srchmode=1&unlock

• Taxonomy ID: 39432 (for references in articles please use NCBI:txid39432)

Necesidades para el funcionamiento de los programas:

· Python

• Version 3 de python
• librerias especificas, en requirements.txt

· Docker

• sudo apt-get install docker-ce

Para correr los programas:

docker run --rm -ti -v (direccion projecto local):/app/data -v (direccion de la carpeta que se creara, una base de datos):/database (nombre del docker) python3 ... parametros segun que programa ejecutes